排污許可證核發(fā)權(quán)限確定的基本原則是“屬地監(jiān)管”以及“誰(shuí)核發(fā)、誰(shuí)監(jiān)管”。根據(jù)《方案》，核發(fā)權(quán)限在縣級(jí)以上地方環(huán)保部門。具體來(lái)看，隨著省以下環(huán)保機(jī)構(gòu)監(jiān)測(cè)監(jiān)察執(zhí)法垂直管理制度改革試點(diǎn)工作的開展，地市級(jí)環(huán)保部門將承擔(dān)更多的核發(fā)工作。對(duì)于地方性法規(guī)有具體要求的，按其規(guī)定執(zhí)行。如寧夏回族自治區(qū)已通過(guò)《寧夏回族自治區(qū)污染物排放管理?xiàng)l例》，該條例明確“對(duì)于總裝機(jī)容量超過(guò)30萬(wàn)千瓦以上的燃煤電廠及石油化工”等重點(diǎn)排污單位，其排污許可證的核發(fā)權(quán)限為自治區(qū)環(huán)境保護(hù)主管部門。環(huán)保部將盡快制定相關(guān)文件，進(jìn)一步明確排污許可證的核發(fā)權(quán)限。

此外，《方案》中還明確上級(jí)環(huán)保部門可依法撤銷下級(jí)環(huán)保部門核發(fā)的排污許可證。《行政許可法》中可以撤銷不當(dāng)行政許可的各種情形，也同樣適用于排污許可證的核發(fā)。